Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1242514	1242595	82	46 [0]	[0] 11	cvrA	predicted cation/proton antiporter

CGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCT  >  W3110S.gb/1242464‑1242513                                                  | cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:577587/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:231183/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:27505/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:288481/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:288736/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:353190/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:36274/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:396852/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:398499/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:49498/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:544800/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1014687/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:58734/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:668638/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:673963/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:692321/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:699657/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:846978/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:864662/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:877987/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:985660/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:99587/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:195550/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1013876/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1060238/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1105340/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1130712/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1194287/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1224485/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1226020/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1230988/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1261008/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1282027/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:134555/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1359303/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1367056/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1415490/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1415565/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:144206/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1458385/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:1465404/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:147206/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:172759/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:228022/1‑50 (MQ=255) cGGAACCACCACTTTGGCTTCTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:997524/1‑50 (MQ=255) cGGAACAACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCt  >  1:943099/1‑50 (MQ=255)                                                  | CGGAACCACCACTTTGGCTTTTTTAGCCGCCCACGAGAGTGATGTTCCCT  >  W3110S.gb/1242464‑1242513

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑