Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1242828	1242971	144	34 [0]	[0] 10	cvrA	predicted cation/proton antiporter

GATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCG  >  W3110S.gb/1242766‑1242827                                                              | gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:55920/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:214705/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:220981/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:289991/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:345720/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:346410/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:436341/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:459195/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:48326/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:199787/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:579597/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:609787/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:623932/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:817670/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:904158/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:946782/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:998534/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:125471/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1039978/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1067360/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1094266/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1125965/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1222852/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:123308/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1009839/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:130091/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1303331/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:131618/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:134130/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1362934/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1374144/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACAAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1288200/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACCAACAGACCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1102983/1‑62 (MQ=255) gATCGCTTGGGTTAACAAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCg  >  1:1237149/1‑62 (MQ=255)                                                              | GATCGCTTGGGTTAACCAACAGCCCCAGCACCAGGAACATGGCGATTTGCGCCAGCCAGGCG  >  W3110S.gb/1242766‑1242827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑