Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1276075	1276133	59	39 [0]	[2] 14	ychP	predicted invasin

CAGCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCG  >  W3110S.gb/1276013‑1276074                                                              | cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:660066/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:225102/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:338141/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:405839/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:45396/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:456415/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:478910/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:488498/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:488747/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:618071/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:166239/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:716842/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:75475/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:771669/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:790659/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:885530/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:889718/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:981270/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:993300/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1230226/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1085916/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1086405/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1091164/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1091702/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1126624/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1135329/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1179273/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1188593/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1025366/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1284624/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:129156/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1353213/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1398184/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1402900/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1440512/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1441653/62‑1 (MQ=255) cagCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGAGCATGCCg  <  1:1229435/62‑1 (MQ=255)   gCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:529746/60‑1 (MQ=255)   gCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCg  <  1:1256026/60‑1 (MQ=255)                                                              | CAGCCACGCAGGAACAACGGATGGCGCGCGGGTACGACCTGACAGCTCGGATGCGCATGCCG  >  W3110S.gb/1276013‑1276074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑