Missing coverage evidence...
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GCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCGTGT  >  W3110S.gb/1306486‑1306547                                                              | gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1082641/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:88899/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:834759/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:823755/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:768176/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:763609/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:754485/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:738620/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:594486/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:509202/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:508157/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:46672/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:446220/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:425360/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:424029/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:323911/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:238305/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1058551/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1159927/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1188352/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1254980/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1290982/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1328333/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1342770/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:1349232/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:146616/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:156680/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:219784/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:224256/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:225742/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:231964/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:251751/62‑1 (MQ=255) gCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgggt  <  1:88993/62‑1 (MQ=255)  cAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:983180/61‑1 (MQ=255)                      caacaGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCgtgt  <  1:381318/41‑1 (MQ=255)                                                              | GCAACTGTGCCGCTCGCACAACAACAGGCTGACGCACTGCTGAACGTGAAAGATTTGCGTGT  >  W3110S.gb/1306486‑1306547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑