Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1378105	1378107	3	19 [0]	[0] 4	ycjR	hypothetical protein

CGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAC  >  W3110S.gb/1378043‑1378104                                                              | cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:4074/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:964058/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:758571/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:733741/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:652004/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:650715/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:646986/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:624858/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:508027/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:492446/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1038088/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:394236/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:256171/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1459731/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1398582/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1307346/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1307138/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1132679/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1130832/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAC  >  W3110S.gb/1378043‑1378104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑