Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1391849	1392414	566	36 [0]	[0] 7	[mpaA]–[ymjC]	[mpaA],[ymjC]

CGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAT  >  W3110S.gb/1391796‑1391848                                                     | cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGTCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:1460911/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:757217/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:582890/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:596642/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:626915/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:635861/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:700919/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:71380/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:714288/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:718067/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:750172/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:560567/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:78173/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:852363/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:86604/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:867034/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:874394/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:929795/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:951255/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:284236/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:1054809/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:1065377/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:1084987/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:1379547/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:153457/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:177895/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:239954/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:275162/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:1026440/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:397441/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:411019/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:418410/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:432452/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:459959/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:473908/53‑1 (MQ=255) cGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAt  <  1:504580/53‑1 (MQ=255)                                                     | CGCCTAATTCGCTGTGTCTGGGATCTTCAATACAGGCCAGTGGATCGTGGAAT  >  W3110S.gb/1391796‑1391848

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑