Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1421854	1421981	128	47 [0]	[1] 13	[racR]	[racR]

AGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTT  >  W3110S.gb/1421792‑1421853                                                              | aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:743378/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:437982/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:464055/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:50091/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:529067/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:542831/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:577237/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:593143/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:65284/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:663745/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:675943/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:731702/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1107987/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:744434/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:766141/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:79899/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:812112/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:831315/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:846037/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:84792/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:885475/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:905843/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:922706/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:9284/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1319808/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1034206/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1109066/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:114791/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1168599/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1178089/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1183928/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1237692/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1246682/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1277054/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1328572/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1372041/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1383159/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:164481/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:256551/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:275776/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:305567/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:335143/62‑1 (MQ=255) aGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:348000/62‑1 (MQ=255)  gTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:312797/61‑1 (MQ=255)   tttATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:410574/60‑1 (MQ=255)   tttATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1202251/60‑1 (MQ=255)         tttACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACttt  <  1:1127017/54‑1 (MQ=255)                                                              | AGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTT  >  W3110S.gb/1421792‑1421853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑