Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1473891	1473964	74	48 [0]	[0] 4	ydbA ydbA	ECK1398:JW5802+JW1402:b4492; predicted outer membrane protein ECK1398:JW1402:b1405; predicted outer membrane protein, C‑ter fragment

TCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGAA  >  W3110S.gb/1473829‑1473890                                                              | tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGTTCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:635532/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGCTCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1099235/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:745090/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1008898/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:462404/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:501961/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:51057/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:52793/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:567476/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:588000/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:588896/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:641833/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:723213/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:423827/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:750526/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:756851/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:817965/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:819217/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:825640/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:858022/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:867134/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:925978/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:967655/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:208406/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1062985/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1079510/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1208960/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1243286/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1245136/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1286540/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1317937/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1330039/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1335010/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:1430102/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:169786/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:378891/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:277802/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:2800/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:311275/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:31135/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:340832/62‑1 (MQ=255) tCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:373040/62‑1 (MQ=255)  cTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:239313/61‑1 (MQ=255)  cTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:489935/61‑1 (MQ=255)  cTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:915929/61‑1 (MQ=255)  cTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:342010/61‑1 (MQ=255)       aaGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:56571/56‑1 (MQ=255)                        cgcTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGaa  <  1:285831/39‑1 (MQ=255)                                                              | TCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGAA  >  W3110S.gb/1473829‑1473890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑