Missing coverage evidence...
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TTGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGTTTATTTA  >  W3110S.gb/1491315‑1491376                                                              | ttGGTGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1212502/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:573043/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1014817/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:314506/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:369783/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:40045/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:437048/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:490864/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:510503/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:5189/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:521984/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:547363/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:565255/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:306483/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:584312/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:663563/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:686757/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:726728/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:733766/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:863202/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:871199/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:935228/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:985756/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:997609/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1197337/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1015194/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1020654/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1077386/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1098289/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1106966/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1124408/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1169561/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1176386/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1189616/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:268129/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1213467/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1299655/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1331413/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1387507/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1400375/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1455327/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:168513/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:222892/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttatcta  <  1:830019/62‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGgttattta  <  1:630886/62‑1 (MQ=255)  tGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1214904/61‑1 (MQ=255)  tGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1312766/61‑1 (MQ=255)                   aaCATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGtttattta  <  1:1432331/44‑1 (MQ=255)                                                              | TTGGCGGCGCAGATGGTAAACATGGCTTGCATGAATATCTGCAGACCCAGGTGGTTTATTTA  >  W3110S.gb/1491315‑1491376

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑