Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1493776	1493797	22	67 [0]	[0] 29	mokB	regulatory peptide

GTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGT  >  W3110S.gb/1493715‑1493775                                                             | gTCTGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACTCCACCAGAGGGt  <  1:569677/61‑1 (MQ=255) gTCAGGGGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1194531/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATTGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:745169/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATGGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:578209/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGATCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:609216/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:521852/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:556665/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:54969/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:530847/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:637352/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:520259/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:519440/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:499041/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:446768/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:438667/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:437105/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:42424/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:420203/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:62153/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:41230/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:648811/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:735542/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:744671/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:756984/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:803818/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:820559/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:821192/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:851111/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:920210/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:928458/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:968574/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:978452/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:980151/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:383067/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1049134/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:10559/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1067388/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1072967/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1103568/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1103976/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1104605/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1108677/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:113381/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1165026/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1188845/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:121533/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1236643/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1264734/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1279934/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:243691/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1025860/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:346760/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:344206/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:309378/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:28099/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1292103/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:229935/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:169695/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1469387/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1331931/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1330848/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1292248/61‑1 (MQ=255) gTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCCTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:476336/61‑1 (MQ=255)  tCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:330577/60‑1 (MQ=255)  tCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1063485/60‑1 (MQ=255)  tCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:632108/60‑1 (MQ=255)             aaTGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGt  <  1:1266065/49‑1 (MQ=255)                                                             | GTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGGGT  >  W3110S.gb/1493715‑1493775

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑