Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1529393	1529430	38	56 [0]	[0] 41	yncH/rhsE	hypothetical protein/rhsE element core protein RshE

CCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAA  >  W3110S.gb/1529331‑1529392                                                              | ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATTATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTTAATaaa  <  1:374574/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTTAATaaa  <  1:1410002/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:605991/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:327312/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:384811/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:410918/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:466105/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:495437/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:515848/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:537865/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:567980/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:576812/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:580209/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:991097/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:608925/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:642909/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:659329/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:682303/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:725724/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:733026/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:773990/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:873006/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:881720/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:902357/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:917377/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:960917/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:320602/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1044839/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1083642/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1088145/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1107847/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1122006/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1125715/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1137245/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1276538/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:134207/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1369269/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1419468/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:325284/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:281926/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:205835/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:18929/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:18493/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:155434/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1456959/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1433006/62‑1 (MQ=255) ccTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1375725/62‑1 (MQ=255)  cTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1055379/61‑1 (MQ=255)  cTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:931524/61‑1 (MQ=255)        cAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:874002/55‑1 (MQ=255)            ccATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:862852/51‑1 (MQ=255)                cattcattTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1237769/47‑1 (MQ=255)                cattcattTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:613665/47‑1 (MQ=255)                  ttcattTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1294100/45‑1 (MQ=255)                   tcattTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1122281/44‑1 (MQ=255)                      tttCAATGATTGTTATTGTATTATTTATTGTTGTGAATaaa  <  1:1034393/41‑1 (MQ=255)                                                              | CCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAA  >  W3110S.gb/1529331‑1529392

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑