Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1558343	1558463	121	68 [0]	[0] 43	osmC	osmotically inducible, stress‑inducible membrane protein

CTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGA  >  W3110S.gb/1558281‑1558342                                                              | ctagTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:375382/59‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACTTAGTCTATAATTTCATTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:562194/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:604268/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:411384/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1040314/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:422707/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:440347/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:443549/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:489844/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:490777/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:496451/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:517543/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:525797/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:543608/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:566600/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:570177/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:412495/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:609376/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:621485/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:632092/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:64653/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:648596/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:705510/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:706937/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:732641/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:754659/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:771188/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:832706/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:885269/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:890119/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:999361/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:999662/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:138973/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1056837/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1062978/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1116986/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:115872/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1170258/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:117426/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1201495/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1208224/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1231991/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1333678/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1373484/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1381251/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:410533/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1426829/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:303715/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:401382/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:382521/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:369515/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:327789/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:305177/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1440886/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:303073/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:280390/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:264517/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:237008/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:228532/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:200284/62‑1 (MQ=255) cTCGTCCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:153769/62‑1 (MQ=255)  tCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCATCAATGa  <  1:939957/61‑1 (MQ=255)  tCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:466518/61‑1 (MQ=255)  tCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:94917/61‑1 (MQ=255)  tCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAAATTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1188763/61‑1 (MQ=255)       cTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:925034/56‑1 (MQ=255)          tttCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:1421231/53‑1 (MQ=255)               cACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGa  <  1:703569/48‑1 (MQ=255)                                                              | CTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAATGA  >  W3110S.gb/1558281‑1558342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑