Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1584041	1584162	122	59 [0]	[0] 42	ydeN	conserved hypothetical protein

TTTTCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGATC  >  W3110S.gb/1583979‑1584040                                                              | ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:756161/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1108135/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:542134/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:560955/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:56442/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:57414/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:582701/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:594608/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:645907/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:667980/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:677229/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:687630/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:750987/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:756120/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:520955/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:757232/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:79614/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:800614/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:804088/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:818132/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:821527/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:898249/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:914270/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:91672/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:947383/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:969995/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:973649/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:988025/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:487389/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1174919/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1198060/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1199934/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1272611/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1321307/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1345972/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1399178/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:141040/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1470927/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:247790/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:330717/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:403317/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:50077/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:48165/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:477660/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:455789/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:403993/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:3868/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:373974/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:353869/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:331303/62‑1 (MQ=255) ttttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACAAAGatc  <  1:233971/62‑1 (MQ=255)  tttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1355961/61‑1 (MQ=255)  tttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:197661/61‑1 (MQ=255)  tttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:975334/61‑1 (MQ=255)   ttCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:466292/60‑1 (MQ=255)          gTTTTTGGGGCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:1409976/53‑1 (MQ=255)               tGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:224385/48‑1 (MQ=255)                        aGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:691383/39‑1 (MQ=255)                           tCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGatc  <  1:919450/36‑1 (MQ=255)                                                              | TTTTCCATTGTTTTTGGGTCAAAAGATCCCTTATCAAAAGGAAGTTGTCCATAACCAAGATC  >  W3110S.gb/1583979‑1584040

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑