Missing coverage evidence...
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CTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAGG  >  W3110S.gb/1666164‑1666218                                                       | cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGTATGTTAgg  >  1:897506/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:423414/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:986697/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:85866/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:837481/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:80117/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:790172/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:75668/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:750272/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:737692/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:690876/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:676081/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:585617/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1156407/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:376217/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:323203/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:181293/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:169097/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1464712/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:141298/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1356359/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:125575/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1251375/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1242290/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1182840/1‑55 (MQ=255) cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAgg  >  1:1159034/1‑55 (MQ=255)                                                       | CTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAGG  >  W3110S.gb/1666164‑1666218

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑