Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1678175	1678489	315	48 [0]	[0] 13	pntA	pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit

CGCTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACT  >  W3110S.gb/1678113‑1678174                                                              | cgcTGAGTCACTGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:745771/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTACTGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:319427/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:723633/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1006196/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:283004/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:312622/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:356937/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:409003/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:4817/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:555694/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:55629/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:587984/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:592897/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:275760/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:774326/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:77520/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:794425/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:800033/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:839632/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:920077/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:925295/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:925628/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:983055/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1189466/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1011131/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1017110/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1017671/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1029038/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1086017/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1100304/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1118335/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1152932/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1178307/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1183787/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:272064/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1261507/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1296067/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:13196/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1366437/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1429865/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1448376/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:181017/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:201214/62‑1 (MQ=255) cgcTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:242159/62‑1 (MQ=255)              tGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:313656/49‑1 (MQ=255)                  gCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1178308/45‑1 (MQ=255)                      ccGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:465771/41‑1 (MQ=255)                          aaaTATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACt  <  1:1022455/37‑1 (MQ=255)                                                              | CGCTGAGTCACGGTGAAGCCACCGAAAATATTAATGCTGGCTATAAGCACCGCGATAAAACT  >  W3110S.gb/1678113‑1678174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑