Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1679442	1679469	28	70 [0]	[0] 17	pntA	pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit

TTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCT  >  W3110S.gb/1679380‑1679441                                                              | tttCATCATCTACCGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1190132/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGTCCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1299490/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGCCGCTATTCCCt  >  1:190480/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:632593/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:695256/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:600822/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:58589/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:57668/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:57087/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:570862/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:568521/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:547883/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:515857/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:487035/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:476418/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:46572/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:43607/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:402333/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:396415/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:883302/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:999153/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:992357/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:968215/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:961602/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:934624/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:930558/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:924357/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:88571/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:654242/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:855000/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:813290/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:812374/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:806474/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:759854/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:754482/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:698597/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:351863/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1099436/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1222002/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1216312/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1215502/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:118736/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1158450/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1140215/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1139506/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1137997/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1222246/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1097751/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1094043/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1085256/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1080324/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1028147/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1021985/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1016815/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:396054/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1244002/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1252234/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1390643/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1421336/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1426904/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1455557/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:153372/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:191865/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:219205/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:231680/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:275121/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:275461/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:310307/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCt  >  1:1013777/1‑62 (MQ=255) tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTACCt  >  1:1333476/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCT  >  W3110S.gb/1679380‑1679441

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑