Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1692389	1692796	408	54 [0]	[0] 21	ydgA	conserved hypothetical protein

ATCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGCC  >  W3110S.gb/1692340‑1692388                                                 | aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:768351/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:525116/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:562871/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:571765/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:5810/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:614543/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:634186/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:662701/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:666875/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:672055/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:680985/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:6955/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:746343/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:75879/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:488413/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:800639/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:821735/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:860626/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:889218/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:900005/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:913838/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:930204/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:957094/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:960076/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:965569/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:973855/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:981405/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1464989/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1060693/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1067308/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1078678/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1156844/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:122051/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1295143/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1295435/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1340785/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1386208/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1390773/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1391483/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1429160/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:146425/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:1012331/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:193469/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:236949/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:251314/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:27955/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:36609/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:37252/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:380584/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:402302/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:421273/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:452083/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:45707/1‑49 (MQ=255) aTCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGcc  >  1:468599/1‑49 (MQ=255)                                                 | ATCAGCGGTAAATCGGATCTGGTCAATGACGGTAAAACGATCAATAGCC  >  W3110S.gb/1692340‑1692388

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑