Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1702436	1702647	212	23 [0]	[0] 35	malX	fused maltose and glucose‑specific PTS enzyme IIBC components

CAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCT  >  W3110S.gb/1702375‑1702435                                                             | cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGTCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:313677/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1412806/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:924551/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:775655/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:765767/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:707270/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:428648/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:353596/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:324475/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:279500/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:163092/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1424496/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1073060/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1400251/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1330643/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1289562/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1265954/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1262124/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1257216/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1220298/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:117643/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1160921/1‑61 (MQ=255) cAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCt  >  1:1078903/1‑61 (MQ=255)                                                             | CAATCGAAAAAGCCGTTGCCGGTGCGCCGGGTAAATCAGGTTACAACGTTCCTGCAATCCT  >  W3110S.gb/1702375‑1702435

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑