Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1750473	1751117	645	43 [0]	[0] 31	ydhT	conserved hypothetical protein

CCTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTCAAC  >  W3110S.gb/1750411‑1750472                                                              | ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:750971/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:369254/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:393991/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:398769/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:425119/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:428093/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:459167/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:490270/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:513800/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:58485/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:742177/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:362703/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:751031/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:754470/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:790910/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:827468/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:837124/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:884378/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:913871/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:933263/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:944373/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1183957/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1038186/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1038382/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1074231/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1089386/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1091942/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1101138/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1103321/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1108913/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1175449/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1034774/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1241596/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1251827/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1255408/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:160611/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:247862/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:252920/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:259706/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:282378/62‑1 (MQ=255) ccTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:284964/62‑1 (MQ=255)  cTGCATCCCGTGCTTGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAATGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:1422654/61‑1 (MQ=255)                        tCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTcaac  <  1:842627/39‑1 (MQ=255)                                                              | CCTGCATCCCGTGCTCGTCGGCGTCTTTCGTTTGATTAAAGGTAAAGCTATCAGCACTCAAC  >  W3110S.gb/1750411‑1750472

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑