Missing coverage evidence...
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AGTAATCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATG  >  W3110S.gb/1753132‑1753193                                                              | agtaatCATCCTTGCTTCCGGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:8697/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTGGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1098839/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:278937/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:92402/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:913111/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:897085/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:882065/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:639472/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:628603/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:614077/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:601722/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:586234/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:466687/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:46327/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:438790/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:371470/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1051669/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:246807/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:207828/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1457459/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1412767/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1398737/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1392308/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1369580/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:134972/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1248886/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1244202/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1174060/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1095610/1‑62 (MQ=255) agtaatCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATg  >  1:1052958/1‑62 (MQ=255)                                                              | AGTAATCATCCTTGCTTCCCGTCAAACAAGCGATATCCGCGTAGTCTCCGTTCTGCTTAATG  >  W3110S.gb/1753132‑1753193

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑