Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1789964	1790274	311	59 [0]	[0] 20	[ydiA]–[aroH]	[ydiA],[aroH]

ATCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGATA  >  W3110S.gb/1789903‑1789963                                                             | aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCGTCGata  <  1:1036750/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:610858/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:192454/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:21136/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:303092/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:306/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:349227/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:350981/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:378823/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:407251/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:409353/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:442314/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:496757/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:571171/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:589763/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1020452/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:633114/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:640234/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:739461/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:758726/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:763920/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:77200/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:79316/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:915040/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:925576/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:995052/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:995570/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1205096/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1134962/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:114617/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1152744/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1154401/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1155308/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1163056/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1108883/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1090418/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1079120/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1196155/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1045205/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1210781/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1030620/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1285290/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1021130/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1310409/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1318611/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1332182/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1429191/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1018719/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:180583/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCCata  <  1:210370/61‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGACACCAAGATCCTCGata  <  1:105038/61‑1 (MQ=255)  tCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:550724/60‑1 (MQ=255)  tCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:413712/60‑1 (MQ=255)  tCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:211218/60‑1 (MQ=255)      gTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:796011/56‑1 (MQ=255)         gATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:40298/53‑1 (MQ=255)          aTTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:514582/52‑1 (MQ=255)               cAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:1176641/47‑1 (MQ=255)                       attattCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGata  <  1:129619/39‑1 (MQ=255)                                                             | ATCCCGTGGATTAACAGTACCAATTATTCGGTAGAAGAGATTGCCACCAAGATCCTCGATA  >  W3110S.gb/1789903‑1789963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑