Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1906288	1906349	62	38 [0]	[0] 28	manZ	mannose‑specific enzyme IID component of PTS

GTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAAC  >  W3110S.gb/1906226‑1906287                                                              | gTGGACACATGTCAACATCCCTCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:596493/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:574153/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:387861/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1001484/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:44651/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:494161/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:536865/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:538766/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:55002/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:550503/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:388120/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:644272/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:710327/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:753861/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:818545/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:851163/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:85144/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:869036/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1192724/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1016544/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1033/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1036937/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1038666/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1064029/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1075315/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1134370/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1185414/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:374325/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1214115/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:125087/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1342970/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1368943/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:1437588/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:144385/62‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:354349/62‑1 (MQ=255)  tGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:572064/61‑1 (MQ=255)  tGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:708132/61‑1 (MQ=255)  tGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAac  <  1:466464/61‑1 (MQ=255)                                                              | GTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAAC  >  W3110S.gb/1906226‑1906287

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑