Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1978720	1978763	44	85 [0]	[0] 19	motA	proton conductor component of flagella motor

GCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATA  >  W3110S.gb/1978682‑1978719                                      | gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:599837/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:737222/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:69838/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:690785/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:684158/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:668815/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:637326/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:631905/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:629953/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:619353/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:61036/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:739554/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:58927/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:561951/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:546327/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:533958/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:517916/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:490780/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:476301/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:460841/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:39752/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:369539/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:84996/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:98938/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:968555/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:952004/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:903011/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:902061/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:886824/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:88126/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:877939/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:866109/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:853961/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:346158/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:843516/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:82839/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:824577/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:821001/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:80246/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:776041/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:775160/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:75488/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:747528/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1141450/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1293795/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1263223/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1241992/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1236110/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1225949/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1211904/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1209347/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1177433/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1173430/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1153992/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:345213/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1138635/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1126593/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1117589/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1112769/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1090348/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1090066/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1058819/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1038312/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1018508/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:219462/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1013019/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:340070/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:334860/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:318587/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:317652/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:301383/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:279507/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:269089/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:262730/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:238033/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:194566/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:188355/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:151488/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1513/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1466694/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1445196/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1431836/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1431253/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATa  >  1:1371550/1‑38 (MQ=255) gCGTGCCGTTAATCGCTTTGCCGTTATTGCCGACGATa  >  1:1332722/1‑38 (MQ=37)                                      | GCGTGCCTTTAATCGCTTTGCCATTATTGCCGACGATA  >  W3110S.gb/1978682‑1978719

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑