Missing coverage evidence...
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ATACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTG  >  W3110S.gb/1996158‑1996219                                                              | aTACGTGCAGCTTCTTCAATCTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1046200/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:275186/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:970339/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:276840/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:315406/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:327762/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:363594/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:398225/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:43758/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:48726/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:542157/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:560851/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:561401/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:566455/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:704663/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:7510/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:797085/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:859615/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:254280/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1231676/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:125124/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1296763/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1299062/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1320482/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1407107/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1417740/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1420745/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1458597/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:156847/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:177177/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:179549/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:196462/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:213515/62‑1 (MQ=255) aTACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGAAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:931791/62‑1 (MQ=255)  tACGTGCAGCTTCTTCTAACTCCAGATTCTTGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:272817/61‑1 (MQ=255)  tACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:402035/61‑1 (MQ=255)  tACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:1017755/61‑1 (MQ=255)   aCGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTg  <  1:632168/60‑1 (MQ=255)                                                              | ATACGTGCAGCTTCTTCAAACTCCAGATTCTGGCTGGCAGTTTCCATACGACTAATGAGTTG  >  W3110S.gb/1996158‑1996219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑