Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2004262	2004411	150	36 [0]	[0] 27	fliC	flagellar filament structural protein

GCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAG  >  W3110S.gb/2004215‑2004261                                               | gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:589650/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:10277/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:464010/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:517848/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:534062/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:539082/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:567097/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:568849/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:570527/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:434106/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:697154/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:721961/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:747347/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:80165/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:857931/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:859184/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:861125/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:929882/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1287505/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1046215/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1087179/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1091282/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1138311/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1170836/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1191426/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1271233/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:402657/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1301580/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1390805/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:151861/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:26646/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:349689/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:351442/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:391642/47‑1 (MQ=255) gCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGAATAACCCTGcagcag  <  1:1442919/47‑1 (MQ=255)      cAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:925065/42‑1 (MQ=255)                                               | GCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAG  >  W3110S.gb/2004215‑2004261

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑