Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2005104	2005202	99	35 [0]	[0] 27	fliC	flagellar filament structural protein

GCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGC  >  W3110S.gb/2005043‑2005103                                                             | gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1010339/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:908652/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:740855/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:564803/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:526078/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:504927/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:469712/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:449045/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:390603/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:291165/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:290809/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:224741/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:158234/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:152272/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1439555/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1406788/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1375622/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1008733/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:123245/61‑1 (MQ=255) gCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1089515/61‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:93556/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:141455/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:916652/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:903409/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:84428/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1118647/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1140878/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:116264/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1214929/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1274925/60‑1 (MQ=255)  cATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1328150/60‑1 (MQ=255)   aTAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1086084/59‑1 (MQ=255)   aTAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:31129/59‑1 (MQ=255)   aTAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:130079/59‑1 (MQ=255)     aGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGc  <  1:1099836/57‑1 (MQ=255)                                                             | GCATAGTAATCATTACCATTATCAGTATAAACACCCTCAATTGAAGCTGGGTTAGTTCCGC  >  W3110S.gb/2005043‑2005103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑