Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2009002	2009288	287	24 [0]	[1] 40	amyA	cytoplasmic alpha‑amylase

CTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCGG  >  W3110S.gb/2008946‑2009001                                                        | cTGGGCGCGCTGGGTGTTGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:95376/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:411715/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:984650/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:949471/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:876176/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:805624/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:704739/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:688196/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:623125/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:604219/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:523970/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1050859/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:333028/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:320456/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:261420/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1359047/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1303085/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1201537/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1201406/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1187926/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1158117/56‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1139694/56‑1 (MQ=255)  tGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:850338/55‑1 (MQ=255)            gggTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCgg  <  1:1405845/45‑1 (MQ=255)                                                        | CTGGGCGCGCTGGGTGATGGAACAAACGCAATGCGACGGTTTTCGTCTTGATGCGG  >  W3110S.gb/2008946‑2009001

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑