Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2024830	2024961	132	41 [1]	[0] 40	fliQ	flagellar biosynthesis protein

ATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTA  >  W3110S.gb/2024774‑2024833                                                        |     atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:578311/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:430807/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:438234/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:440170/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:471637/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:477601/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:489523/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:503556/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:550730/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:576511/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:429316/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:589319/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:595369/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:606456/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:610483/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:616712/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:687768/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:798175/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:822062/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:878615/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1381773/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:102492/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1069097/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1145215/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1269661/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1289213/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1310136/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1326369/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1342783/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1353153/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1018182/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:1440143/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:160629/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:255460/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:290950/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:293099/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:310408/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:352966/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:368337/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt      >  1:427686/1‑56 (MQ=255) atgatgGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTa  >  1:625493/1‑60 (MQ=255)                                                        |     ATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTA  >  W3110S.gb/2024774‑2024833

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑