Missing coverage evidence...
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CAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGC  >  W3110S.gb/2024962‑2025023                                                              | cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCTCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1394834/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:619589/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:395080/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:441693/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:469455/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:482345/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:520249/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:535768/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:576162/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:606185/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:608606/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:393375/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:621829/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:648427/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:651134/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:723003/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:760684/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:778626/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:82336/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:897868/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:925498/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:999283/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1376097/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1154053/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1137040/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1221417/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1261277/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1278203/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1290911/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1315910/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:133053/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1442225/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:197763/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:20985/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:255191/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:257823/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:304437/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:377466/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1028037/62‑1 (MQ=255) cAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGAATATCATCGGGTAGc  <  1:390298/62‑1 (MQ=255)   aTCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1079736/60‑1 (MQ=255)        ttGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:1211840/55‑1 (MQ=255)                  aCGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGc  <  1:988962/45‑1 (MQ=255)                                                              | CAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGC  >  W3110S.gb/2024962‑2025023

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑