Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2057088 2057474 387 41 [0] [0] 67 [shiA]–[amn] [shiA],[amn]

TTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCAA  >  W3110S.gb/2057026‑2057087
                                                             |
tttatttGCTGGGTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:991209/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGTTTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1308860/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:264556/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:17153/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:322609/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:333781/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:378354/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:406842/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:477716/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:494671/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:579271/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:591157/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:627998/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:636814/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:775137/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:829941/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:861432/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:882978/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:885013/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:9326/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:95207/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:122033/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1036774/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1112449/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1135762/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1143668/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1157670/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1184723/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1192840/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1200708/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:10290/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1233492/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1305308/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1357817/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1360497/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1369789/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1404000/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:144025/62‑1 (MQ=255)
tttatttGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:165478/62‑1 (MQ=255)
               gATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:1064215/47‑1 (MQ=255)
                       aTTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCaa  <  1:485254/39‑1 (MQ=255)
                                                             |
TTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGACAGTCAA  >  W3110S.gb/2057026‑2057087

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: