Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2075761 2075813 53 10 [0] [1] 53 flu antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

TCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT  >  W3110S.gb/2075702‑2075760
                                                          |
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:10426/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:1317342/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:1319070/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:1392612/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:3398/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:458666/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:533063/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:757255/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:76543/1‑59 (MQ=255)
tCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat  >  1:931134/1‑59 (MQ=255)
                                                          |
TCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT  >  W3110S.gb/2075702‑2075760

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: