Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2148172	2148241	70	24 [0]	[0] 39	yegE	predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein

TTATTGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAC  >  W3110S.gb/2148110‑2148171                                                              | ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:20352/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:613125/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:586466/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:568585/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:562383/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:543332/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:511486/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:409392/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:404598/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:234826/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1011269/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1432980/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1395798/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1370684/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1322783/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1320689/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1193524/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1182702/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1139639/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1122456/62‑1 (MQ=255) ttattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1118192/62‑1 (MQ=255)  tattGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:476219/61‑1 (MQ=255)  tattGATGAACAAACATTTCGGCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:235270/61‑1 (MQ=255)                           aGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAc  <  1:1419740/36‑1 (MQ=255)                                                              | TTATTGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATCCGGCGCTTAGCCATGCTCTTGAC  >  W3110S.gb/2148110‑2148171

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑