Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2166092	2166399	308	37 [0]	[0] 11	baeS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BaeR

CCGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATAA  >  W3110S.gb/2166049‑2166091                                           | ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:622462/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:293718/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:324351/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:364213/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:403582/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:4206/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:443311/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:518929/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:541826/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:606088/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:25431/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:663592/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:664064/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:684075/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:703682/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:731171/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:774755/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:79055/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:855191/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1361233/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:102213/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1132955/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1197407/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1205662/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1256007/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1308739/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1008624/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1368565/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1396838/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1429521/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1443459/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:146973/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:165049/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:18988/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:217791/1‑43 (MQ=255) ccGTATTTGGCGATCGCGACCGTATAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1338907/1‑43 (MQ=255)   gTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATaa  >  1:1079740/1‑41 (MQ=255)                                           | CCGTATTTGGCGATCGCGACCGTTTAATGCAGTTATTCAATAA  >  W3110S.gb/2166049‑2166091

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑