Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2171872	2171910	39	49 [0]	[0] 25	gatR gatR	DNA‑binding transcriptional regulator, N‑ter fragment; ECK2083:JW5340:b2087 DNA‑binding transcriptional regulator; ECK2083:JW5340+JW2074:b4498

CAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAG  >  W3110S.gb/2171825‑2171871                                               | cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:546318/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:271297/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:278334/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:31250/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:345058/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:372859/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:384657/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:394744/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:403467/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:417256/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:505201/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:531448/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:538272/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:25612/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:549034/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:629860/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:640077/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:665791/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:720669/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:731988/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:75032/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:792627/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:812565/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:906323/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:910959/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1318961/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1009039/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1041818/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1079138/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1079494/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1106653/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1178652/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1225537/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1252054/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1265250/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1283458/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1303421/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1008300/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1327169/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1347530/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1392889/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1400972/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1404096/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1433180/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1441190/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1452097/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:1463868/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:237333/1‑47 (MQ=255) cAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAg  >  1:244143/1‑47 (MQ=255)                                               | CAATACTACACCGTAATTAATTTTACCCGCGTCTTCTGCAATGCCAG  >  W3110S.gb/2171825‑2171871

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑