Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2188228	2188371	144	46 [0]	[0] 21	thiM	hydoxyethylthiazole kinase

CAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAT  >  W3110S.gb/2188167‑2188227                                                             | cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCAGTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:826927/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:560460/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1017729/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:348016/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:362299/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:380920/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:398467/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:408172/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:510388/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:515915/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:535324/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:543810/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:312355/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:585371/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:612868/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:621549/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:63964/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:77526/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:821485/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:890718/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:939219/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:994118/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1294302/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1073388/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:109812/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1133643/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1159139/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:116564/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1166826/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:118650/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1249139/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1367961/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1374672/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1441538/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:1443292/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:153784/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:15575/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:191170/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:21845/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:228848/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:252584/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGGCCGCCATTAGCAAt  <  1:1192524/61‑1 (MQ=255) cAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGGGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:198830/61‑1 (MQ=255)  aGCGTGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:972511/60‑1 (MQ=255)  aGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:7831/60‑1 (MQ=255)   gCGGGTATCGCGTTAGCGGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAt  <  1:295703/59‑1 (MQ=255)                                                             | CAGCGGGTATCGCGTTAGCTGCGGCGTCAGTGGTATCCACTCCCCGTCCGCCATTAGCAAT  >  W3110S.gb/2188167‑2188227

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑