Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2188999	2189037	39	34 [0]	[0] 20	yohL	conserved hypothetical protein

TAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAT  >  W3110S.gb/2188959‑2188998                                        | tAATCACTTCCCGCATCAGTCCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:243421/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACTGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:125876/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTAGCGCGCCACGGAt  <  1:764718/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:524879/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:40374/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:412982/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:419943/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:421554/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:462946/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:467421/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:494509/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:330073/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:674069/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:683791/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:801243/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:855633/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:958231/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:959920/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1005027/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:329219/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:329006/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:261089/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:246619/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:212538/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:144779/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1408015/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1320120/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1292133/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1245593/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1071265/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:1015149/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCAGACCATTTACCGCGCCACGGAt  <  1:80607/40‑1 (MQ=255) tAATCACTTCCCGCATCACACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:280939/40‑1 (MQ=255)    tCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAt  <  1:318901/37‑1 (MQ=255)                                        | TAATCACTTCCCGCATCAGACCGTTTACCGCGCCACGGAT  >  W3110S.gb/2188959‑2188998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑