Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2236726	2236770	45	48 [0]	[0] 41	sanA	hypothetical protein

CGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAC  >  W3110S.gb/2236665‑2236725                                                             | cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:550244/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:238589/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:299837/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:347396/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:392342/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:414075/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:434361/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:455515/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:458913/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:517712/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:527256/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:530949/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:236303/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:577356/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:585930/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:58982/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:592142/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:599180/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:66530/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:694531/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:732483/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:870927/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:875304/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:932002/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1361189/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1093656/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1105259/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1198049/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1231099/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1245169/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1247838/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1288424/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:129307/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1297044/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:132526/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1356334/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1000685/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1371170/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1427713/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1428194/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:144461/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1465680/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1472198/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:154711/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:173401/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:182219/61‑1 (MQ=255) cgagcATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:220050/61‑1 (MQ=255)                      cATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAc  <  1:1362088/40‑1 (MQ=255)                                                             | CGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCAC  >  W3110S.gb/2236665‑2236725

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑