Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2333727	2333777	51	34 [0]	[0] 26	yfaQ	hypothetical protein

TCAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCGG  >  W3110S.gb/2333666‑2333726                                                             | tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:73088/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:508411/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:548481/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:583673/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:609165/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:614057/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:670579/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:68352/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:723093/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:469578/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:797688/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:799712/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:806862/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:833899/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:854017/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:907700/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:924198/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:21762/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1099912/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1170003/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1176770/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1189389/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1285963/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1309934/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:142594/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:163195/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:1094504/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:250002/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:282764/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:33409/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:396202/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:415135/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:442489/61‑1 (MQ=255) tcAGCGGATAGCGGACAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCgg  <  1:276608/61‑1 (MQ=255)                                                             | TCAGCGGATAGCGGGCAAACAGCTCCACCTCTACACATTGCCCACTGGCAACCTGCGTCGG  >  W3110S.gb/2333666‑2333726

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑