Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2338627	2338699	73	38 [0]	[0] 45	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

GCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTGAGAA  >  W3110S.gb/2338575‑2338626                                                    | gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTTAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1193583/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:670012/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:246067/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:270841/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:273977/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:293716/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:358598/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:437263/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:517281/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:547404/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:639786/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:240065/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:696432/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:741334/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:75748/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:837842/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:863338/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:960237/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:963766/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1214270/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1018979/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1030822/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1067873/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:110344/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1156386/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:116567/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1194690/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1195801/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1004270/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1255745/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1283419/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1391036/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:141413/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1415538/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1456654/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:1471441/52‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:199585/52‑1 (MQ=255)  ccGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaa  <  1:800416/51‑1 (MQ=255)                                                    | GCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTGAGAA  >  W3110S.gb/2338575‑2338626

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑