Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2499611	2499733	123	42 [0]	[0] 29	yfdX	hypothetical protein

TTTGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAC  >  W3110S.gb/2499734‑2499794 |                                                             tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1143086/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:932501/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:886042/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:850036/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:804856/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:786454/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:58877/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:57507/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:554511/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:4897/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:4705/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:408069/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:389176/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:382949/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:178480/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1451840/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:134205/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1290764/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1263815/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1247587/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1238761/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1210196/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1208481/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1150690/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1091713/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTA‑CTGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:806452/60‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCAACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1258352/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCAACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:1256686/61‑1 (MQ=255) tttGCTGAACTTACTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAc  <  1:943294/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTTGCTGAACTTGCTGAGTTTGCTGTTGTGCCGCTACCGGAGCATTATCAGCAGCCCATAC  >  W3110S.gb/2499734‑2499794

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑