Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2552570	2552589	20	67 [0]	[0] 46	murP	fused predicted enzyme IIBC components of PTS

GCGCTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCTGGTGGGC  >  W3110S.gb/2552590‑2552652 |                                                               gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTTTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1142513/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:675342/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:355569/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:374901/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:445896/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:464898/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:492908/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:55239/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:55364/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:59769/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:599769/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:621640/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:639479/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:347073/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:747005/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:756325/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:778089/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:84063/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:85537/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:88138/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:887737/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:895456/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:934677/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1340998/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:109567/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1133349/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1143458/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1182626/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1234044/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1255941/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1255997/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1314649/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1324874/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1019470/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1371723/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1419772/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:1421559/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:200932/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:259974/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:270871/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:303543/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:32770/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:331305/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtgg    >  1:338333/1‑61 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCtggtg     >  1:1276139/1‑60 (MQ=255) gcgcTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCT‑GTGATTCTGGTGGGc  >  1:85273/1‑62 (MQ=255) |                                                               GCGCTGAATTTTATGAAGGTGTTCAGCAAAGGTTTGTTCACTTTCCTGGTGATTCTGGTGGGC  >  W3110S.gb/2552590‑2552652

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑