Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2591360 2591532 173 6 [0] [2] 79 [dapE]–[ypfN] [dapE],[ypfN]

AAGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCG  >  W3110S.gb/2591532‑2591594
 |                                                             
aaGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGcc   <  1:210043/62‑1 (MQ=255)
aaGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGcc   <  1:211703/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTGAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1343274/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:450997/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:348388/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:505891/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:504661/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:49188/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:484672/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:483399/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:482331/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:47451/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:362965/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:304950/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:348968/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:436986/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:422626/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:416759/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:406208/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:405759/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:389832/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:7793/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:989368/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:938544/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:930694/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:923982/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:878046/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:866585/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:83199/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:827335/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:813236/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:507172/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:732866/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:71917/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:685760/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:683850/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:667278/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:597562/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:53033/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:525310/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:523515/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1201359/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1321831/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1278696/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:127296/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1267820/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1266317/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1265990/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1253501/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1229639/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1211742/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1329231/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1123465/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1104392/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1097363/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1079956/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1059743/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1047267/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:101916/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1015441/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:182150/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:308307/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1013495/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:281373/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:255960/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:234452/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:230550/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:227240/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:224869/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:312646/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:161476/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:15516/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:144920/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1419306/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1398894/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1371751/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCg  <  1:1354106/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATAACGACGACTGGCCg  <  1:283175/62‑1 (MQ=255)
 aGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGACGACGACGACTGGCCg  <  1:150050/62‑1 (MQ=255)
 |                                                             
AAGCCGGAGCTTCCCCCGCATCGTGATTTCAACGATAAGTGGGACGATGACGACGACTGGCCG  >  W3110S.gb/2591532‑2591594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: