Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2599827	2600159	333	45 [0]	[0] 26	[hyfA]	[hyfA]

AGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACGG  >  W3110S.gb/2600160‑2600221 |                                                              aGCCGTCCGGTGAATGCGCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:265315/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:254312/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:848098/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:797723/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:741794/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:69804/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:665488/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:609456/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:541437/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:409135/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:339946/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:254335/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1087542/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:217914/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:189649/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:167871/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:149011/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1435124/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1425446/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1414392/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1412736/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1397035/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1344766/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:1175644/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:110465/62‑1 (MQ=255) aGCCGTCCGGTGAATGCCCACGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACgg  <  1:271440/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGCCGTCCGGTGAATGCCCATGCGCAATATGTTTTTCAGGCTGAAGGCTCACTCAAAGACGG  >  W3110S.gb/2600160‑2600221

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑