Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2650554	2650592	39	28 [0]	[0] 36	yfhM	conserved hypothetical protein

CAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTGAGA  >  W3110S.gb/2650593‑2650654 |                                                              cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAAcgc        >  1:923898/1‑56 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1053375/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:966335/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:961479/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:958613/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:947394/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:795771/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:705496/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:587743/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:585377/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:516710/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:455209/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:346394/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:327772/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:308899/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:30073/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:19572/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1045530/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1060320/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1179480/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1205505/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1223058/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1227414/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1274446/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1310811/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1315881/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1448358/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgag   >  1:556514/1‑61 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgag   >  1:1257759/1‑61 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgag   >  1:1428677/1‑61 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgag   >  1:1430301/1‑61 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgag   >  1:232507/1‑61 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgag   >  1:980602/1‑61 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACACGTgaga  >  1:985112/1‑62 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCACTATGCCGCtttttt                             >  1:310624/1‑35 (MQ=255) cAGCTCCCAGGCACCATCCAATTTGACGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTgaga  >  1:1461255/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAGCTCCCAGGCACCATCCACTTTGCCGCTTTTTTTATCGACGACATGAATAACGCGTGAGA  >  W3110S.gb/2650593‑2650654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑