Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2700852	2700960	109	44 [0]	[0] 38	recO	gap repair protein

AGGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCAA  >  W3110S.gb/2700961‑2701022 |                                                              agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:792160/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:390326/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:41995/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:462957/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:47865/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:503816/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:58990/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:590712/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:640850/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:779138/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:384894/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:81390/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:822587/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:843680/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:846209/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:846554/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:885846/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:927257/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:985163/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:135795/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1112091/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1113358/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1121738/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1124312/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1133566/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1214583/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1291849/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1297872/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1304709/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1021951/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:1380261/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:157430/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:161745/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:19937/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:2829/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:295327/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:299798/62‑1 (MQ=255) agGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCaa  <  1:317553/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGGGGTGAAAGGCTGTAATGCACCTTTCAGGGTAGAGCGTTTAGAGCGTGCGCCTTTGGCAA  >  W3110S.gb/2700961‑2701022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑