Missing coverage evidence...
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GAGAACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATTAT  >  W3110S.gb/2730057‑2730117 |                                                             gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:660337/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:285317/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:288669/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:297267/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:297838/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:355312/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:421946/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:574245/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:625059/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:632536/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:277521/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:660525/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:663/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:676920/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:776657/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:841060/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:919482/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:95280/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:984603/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:984925/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1378733/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:103360/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1071403/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1103102/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1222130/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1235445/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:127011/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1300250/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1302885/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1371902/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1022165/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1395928/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:1402466/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:17648/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:204013/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:215656/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:253706/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:262767/61‑1 (MQ=35) gagaACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATtat  <  1:276687/61‑1 (MQ=35) |                                                             GAGAACCCCGCCGACCCGGCGGCGTGTTTGCCGTTGTTCCGTGTCAGTGGTGGCGCATTAT  >  W3110S.gb/2730057‑2730117

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑