Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2734290	2734319	30	40 [0]	[0] 14	rluD	23S rRNA pseudouridine synthase

CAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTAA  >  W3110S.gb/2734320‑2734381 |                                                              cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCATGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1358831/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1023725/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1105878/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1123697/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1159202/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1209480/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1444950/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:1452231/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:196346/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:221488/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:339382/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:375020/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:624006/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTaa  <  1:734950/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCGCGGTTTATTAA  >  W3110S.gb/2734320‑2734381

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑