Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2754263	2754271	9	57 [0]	[1] 36	smpB/intA	trans‑translation protein/integrase

GGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAT  >  W3110S.gb/2754271‑2754333  |                                                              ggATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGT‑AAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1464228/62‑1 (MQ=255)  gATTTTCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1333707/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:825298/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:33189/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:379658/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:464699/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:511182/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:538862/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:63212/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:762132/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:823948/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:243170/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:830691/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:850859/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:900843/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:940472/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:963927/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:9640/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:971745/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1398932/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1089552/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1191369/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1237930/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1243660/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1253483/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1306067/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1368644/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1392960/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:303956/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:141625/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1428357/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1470160/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1471230/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:198390/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:213125/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAt  <  1:1056133/62‑1 (MQ=255)  |                                                              GGATTTGCGAAACCCAAGGTGCATGCCGAGGGGCGGTTGGCCTCGTAAAAAGCCGCAAAAAAT  >  W3110S.gb/2754271‑2754333

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑