Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2771851	2771892	42	60 [0]	[0] 35	ypjM/yfjW	CP4‑57 prophage region; ECK2637:JW5420:b2641; hypothetical protein/predicted inner membrane protein

ATGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAGG  >  W3110S.gb/2771893‑2771954 |                                                              aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:584063/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:920237/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:889260/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:829626/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:806411/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:774011/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:770976/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:747074/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:621915/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:592149/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:527777/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:47034/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:43136/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:414487/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:247121/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:205515/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:187575/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:1358522/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:1255589/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:1233884/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:1209426/60‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:467668/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:1130728/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:881263/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:1138490/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:826470/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:818190/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:813816/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:1197181/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:79169/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:755311/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:639189/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:615534/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAgg  <  1:1053097/62‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGTTGCCAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTaaa    <  1:1099567/60‑1 (MQ=255) |                                                              ATGAAATTGGTTGCTAGAAAGTCGATGATTTGTTGCGTATGATTAAAAATCAACCTTAAAGG  >  W3110S.gb/2771893‑2771954

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑