Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2774688	2774691	4	23 [0]	[0] 63	yfjX	predicted antirestriction protein

ATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGC  >  W3110S.gb/2774692‑2774742 |                                                   aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCTTTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1242703/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGAccc   <  1:444859/50‑2 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:528356/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:745158/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:72984/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:711191/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:690949/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:662029/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:597559/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:560572/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:767238/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:483074/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:454255/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:431312/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:425757/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:408212/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:401950/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:38053/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:773757/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:821780/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:826868/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:833307/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:833904/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:840421/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:870239/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:881143/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:910928/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:913269/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:966699/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:970391/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:98986/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:996505/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1361503/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1013778/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1039108/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1039847/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:106795/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1139521/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:11876/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1199867/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1200990/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1202415/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1226389/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1229352/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:128148/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1288517/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:132120/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1335678/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:398429/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:136962/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1375586/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1453722/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:147783/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:157432/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:195132/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:205369/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:243529/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:279276/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:285289/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:324965/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:366479/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:367352/51‑1 (MQ=255) aTCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGc  <  1:1013305/51‑1 (MQ=255) |                                                   ATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGC  >  W3110S.gb/2774692‑2774742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑